[桂花树价格]桂花根际球孢白僵菌遗传多样性的ISSR分析
时间:2019/9/14 6:42:39 浏览量:
为了阐明在根际樨遗传分化和亲缘关系白僵菌,从根际樨分离遗传多样性白僵菌通过ISSRPCR分子标记的技术的研究。40个引物中共筛选出11个具有高多态性和稳定性的引物进行正式扩增分析,37个菌株共扩增出83个条带,其中69条为多态性条带。态性百分比为83.13%。个引物的平均扩增条带为7.5。
态位点(PPL)的人口的百分比为83.13%,NEI基因的多样性指数0.316(H)和信息Shannon指数(I)0.465 7.结果表明,从安徽省Gu阳县,萧县县和蒙城县三个地区分离出的球孢白僵菌具有较高的遗传多样性。研究结果对进一步研究白僵菌不同菌株对生物防治的影响具有重要意义。僵菌作为重要的生物防治资源,球孢白僵菌可用于控制农业,林业和卫生等各种害虫,并取得了成功[13]。僵菌是白僵菌最着名的种类,它具有多种宿主,可以感染超过700种昆虫,包括15目和149科。是一种具有重要价值的昆虫病原真菌[47]。着分子生物学技术的飞速发展和新技术的出现,人们已经开始利用分子生物学研究技术,研究虫生香菇的遗传多样性,这抵销了形态变化强和与传统的分类方法相比,文化特征。些都提供了种株的遗传关系鉴定的可靠依据,有助于加强对虫生香菇的遗传多样性研究和释放菌株的检测和监控提供了可靠的依据。今为止,已经使用各种分子DNA标记技术来研究球孢白僵菌种群的遗传多样性。贵Ding等人[8]研究白僵菌人口的松林主机传递和遗传多样性在连续监测松毛虫通过同工酶estérase.Les结果的影响表明白僵菌是在松树林中暴露的。富的遗传多样性方志刚等[9],林华峰等。[10]利用RAPD技术分析球孢白僵菌菌株的遗传分化,发现菌株之间存在丰富的遗传多态性,以及菌株与收集位点之间的DNA多态性。
Li等人[18]所用的ISSR分子标记技术来研究在不同高度,并在安装在大别安徽不同时期收集的遗传多样性白僵菌,发现白僵菌更安徽省大别山高。传多样性,其中种群间的遗传变异相对较低,并且种群具有较高水平的遗传分化。小磊等[19]使用的ISSR技术来分析遗传多样性和球孢白僵菌的南部Chine.Les结果人口的遗传结构表明,球孢白僵菌的遗传多样性较大和的异质人口更强大。究表明,球孢白僵菌广泛分布于不同的生态环境中,包括根际和植物组织[2021]。花是安徽重要的粮食和饲料,经常在生长过程中通过土壤传播的地下病虫害的威胁,了解根际桂花分布白僵菌香,安徽省Gu阳县。际土壤样品很大程度上收集在三个区域中萧县和蒙城,37和球孢白僵菌菌株的县种植桂花通过稀释和分离[22]进行分离。本文中,我们使用了ISSRPCR技术来识别来自不同区域的基因结构和遗传关系白僵菌,并研究DNA地图白僵菌和应变的地理起源之间的关系。进一步研究37种菌株对桂花地下病虫害和土传病害的生物防治效果提供依据。37株白僵菌分离在涡阳,萧县和蒙城县安徽收集桂花根际土壤是通过用相关联的ADNr-形态学方法鉴定ITS以Beauveria bassiana的名义。阳阳县有22株,分别为GY1 - GY4,GY6 - GY20,GY22,GY23,GY25;蒙城县9号,编号MC2,MC7 - MC14;萧县6号,编号XX1,XX3,XX5,XX6。XX12,XX13。SDAY培养基[23]:酵母渗滤液10克;蛋白胨10克;葡萄糖40克;琼脂15克; 1000毫升水。Taq DNA聚合酶购自TaKaRa; dNTPs,DNA标记物等购自上海圣工生物工程有限公司40个ISSR引物由上海英俊生物技术有限公司合成。试验菌株中的孢子悬浮液转化,0.2毫升在25℃下转移至介质SDAY板涂覆玻璃纸并放置在恒温培养箱中4〜6天,将其侵入没有多少数量。无菌条件下除去孢子形菌丝体,置于无菌5ml微量离心管中,桂花树价格冻干并储存在-20℃直至使用。用改良的CTAB方法[24]提取白僵菌的基因组DNA。
40个引物的37个souches.Les号码和引物序列进行PCR扩增选择具有清晰的多态性,重复性高十一ISSR引物示于表1扩增反应与ISSRPCR反应系统25微升:超纯水(ddH 2 O中)19.5微升,10×缓冲液缓冲液(含Mg 2+的)2.5微升,的dNTP(浓度为2.5mmol / L)1.25微升,引物(浓度为10毫摩尔/ L 0.1μL,Taq DNA聚合酶(5U /μL)0.2μL,50ng /μL的0.5μL模板DNA。PCR扩增过程ISSR:预变性94℃5分钟,变性在45℃下45秒,退火温度1分钟,延伸72℃1分钟,35个循环,延伸在72℃ 10分钟每种引物测试三次,每个反应用无矩阵空白对照物制备。过2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。动读取ISSR电泳凝胶图像,并将每个扩增的片段计数为多态性位点。ISSR是显性标记和各样品的扩增条带被记录有或没有带,条带1和条带无0 DNA凝胶的电泳图被转换成数值矩阵。物NTSYSpc 2.1软件被用于使用软件PopGen 32分析所有人群和所有种群的遗传参数来分析每个应变之间的关系的树,并计算观察到的等位基因的数目(NA)。位基因数(NE),基因多样性指数NEI(1973年)(他),索引信息香农多样性(I),多态位点(PPL)的百分比,基因内基因多样性(HS)基因总人口多样性(Ht),群体间遗传分化系数(Gst),Nei遗传距离(1978)(D)和遗传同一性(I)。预试验中,选择40个引物,并调整为与确定的结果stables.Les 11米的引物具有良好的多态型的光带不同的引物的退火温度被用来分析37株球孢白僵菌。态性检测。表2所示,11种引物能够扩增所测试的37种菌株的光和亮条带,并且条带以合理的方式分布。同引物共扩增出83条带,其中多态性带69条,多态性百分率为83.13%。
体之间的基因流动为1.530 8.表3-5显示三个群体之间的基因流动和由此产生的基因分化差异很大,包括在阳阳县和Gu阳县的基因流动。城是最大的(4,563 7),基因分化系数最低(0,051 9),两个采样点之间的地理距离为44 km。蒙城和萧县县基因流最低(1.237 1),基因分化系数最高(0.168 1)和两个采样点之间的地理距离为133公里。Gu阳县和萧县的基因流量为1,889 7,基因分化系数为0.116。个采样点之间的地理距离为84公里。表明遗传分化系数与地理位置无关。过使用软件来涡阳,蒙城和萧县的县的三个群体的两个群体之间分析POPGENE 32 NEI遗传同一性(I)和标准遗传距离(d)中,我们发现,不同区域之间的遗传距离( D)在0.048和0.1244之间,平均值为0.085,遗传同一性(I)在0.883和0.952之间,平均值为0.918(表3-6)。中,涡阳和蒙城之间的遗传一致性最高(0.952 4)中,遗传距离是接近的(0.048 8),蒙城和萧县间的遗传一致性是最低(0.883 0)和遗传距离是最远的(0.124)。4)根据扩增的ISSRPCR条带的存在或不存在,计数稳定和清晰的条带,计数为0.1。
该研究中,通过初步实验调节一些引物的退火温度。是,该测试没有研究其他因素的影响,如仪器类型,反应体积等。于扩增产品。者检查了实验前置放大器40个引物和扩增引物stables.Les 11个引物的37好多态性扩增多态性株白僵菌和分析了放大地图ISSR 。物表现出较高的遗传多态性,多态性条带达到83.13%,扩增结果具有高度可重复性。此,ISSR分子标记是研究白僵菌等白僵菌的遗传多样性和种群结构的有效方法。POPGENE 32软件进行了分析,分析了安徽省不同地区37株的群体遗传多样性。果表明,从安徽省3个不同地区分离的球孢白僵菌的遗传多样性优越,呈多态性。因座百分比(PPL)为83.13%,Nei遗传多样性指数为0.316,Shannon信息指数为0.465 7.遗传变异的结果表明存在分化。同的遗传群体白僵菌之间:三个群体的总遗传多样性是0.140 4.使用软件群体内0.301 1遗传多样性0.258 8和分化NEI基因的系数NTSYSPC,基于个体之间的遗传距离构建了37株球孢白僵菌菌株的遗传系统发育图谱。果表明,37个测试菌株不按地理种群聚类,分类组按地理划分。源之间没有直接的相关性,进一步表明种群间的遗传变异较小,可能是因为从桂花根际土壤中分离出的37株白僵菌(Beauveria bassiana)。在于根际土壤中。孢白僵菌可以受到土壤中复杂环境因素的影响,并且可以进行突变以适应相应的环境变化。项研究的结果表明,涡人口涉及的所有群体,表明人口有最大的遗传异质性,第二是蒙城,谁没有第Ⅲ部分的人口,而人口xiaoxienne具有最低的遗传异质性,并且汇集了所有七个菌株。第一个主要类别。
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态位点(PPL)的人口的百分比为83.13%,NEI基因的多样性指数0.316(H)和信息Shannon指数(I)0.465 7.结果表明,从安徽省Gu阳县,萧县县和蒙城县三个地区分离出的球孢白僵菌具有较高的遗传多样性。研究结果对进一步研究白僵菌不同菌株对生物防治的影响具有重要意义。僵菌作为重要的生物防治资源,球孢白僵菌可用于控制农业,林业和卫生等各种害虫,并取得了成功[13]。僵菌是白僵菌最着名的种类,它具有多种宿主,可以感染超过700种昆虫,包括15目和149科。是一种具有重要价值的昆虫病原真菌[47]。着分子生物学技术的飞速发展和新技术的出现,人们已经开始利用分子生物学研究技术,研究虫生香菇的遗传多样性,这抵销了形态变化强和与传统的分类方法相比,文化特征。些都提供了种株的遗传关系鉴定的可靠依据,有助于加强对虫生香菇的遗传多样性研究和释放菌株的检测和监控提供了可靠的依据。今为止,已经使用各种分子DNA标记技术来研究球孢白僵菌种群的遗传多样性。贵Ding等人[8]研究白僵菌人口的松林主机传递和遗传多样性在连续监测松毛虫通过同工酶estérase.Les结果的影响表明白僵菌是在松树林中暴露的。富的遗传多样性方志刚等[9],林华峰等。[10]利用RAPD技术分析球孢白僵菌菌株的遗传分化,发现菌株之间存在丰富的遗传多态性,以及菌株与收集位点之间的DNA多态性。
Li等人[18]所用的ISSR分子标记技术来研究在不同高度,并在安装在大别安徽不同时期收集的遗传多样性白僵菌,发现白僵菌更安徽省大别山高。传多样性,其中种群间的遗传变异相对较低,并且种群具有较高水平的遗传分化。小磊等[19]使用的ISSR技术来分析遗传多样性和球孢白僵菌的南部Chine.Les结果人口的遗传结构表明,球孢白僵菌的遗传多样性较大和的异质人口更强大。究表明,球孢白僵菌广泛分布于不同的生态环境中,包括根际和植物组织[2021]。花是安徽重要的粮食和饲料,经常在生长过程中通过土壤传播的地下病虫害的威胁,了解根际桂花分布白僵菌香,安徽省Gu阳县。际土壤样品很大程度上收集在三个区域中萧县和蒙城,37和球孢白僵菌菌株的县种植桂花通过稀释和分离[22]进行分离。本文中,我们使用了ISSRPCR技术来识别来自不同区域的基因结构和遗传关系白僵菌,并研究DNA地图白僵菌和应变的地理起源之间的关系。进一步研究37种菌株对桂花地下病虫害和土传病害的生物防治效果提供依据。37株白僵菌分离在涡阳,萧县和蒙城县安徽收集桂花根际土壤是通过用相关联的ADNr-形态学方法鉴定ITS以Beauveria bassiana的名义。阳阳县有22株,分别为GY1 - GY4,GY6 - GY20,GY22,GY23,GY25;蒙城县9号,编号MC2,MC7 - MC14;萧县6号,编号XX1,XX3,XX5,XX6。XX12,XX13。SDAY培养基[23]:酵母渗滤液10克;蛋白胨10克;葡萄糖40克;琼脂15克; 1000毫升水。Taq DNA聚合酶购自TaKaRa; dNTPs,DNA标记物等购自上海圣工生物工程有限公司40个ISSR引物由上海英俊生物技术有限公司合成。试验菌株中的孢子悬浮液转化,0.2毫升在25℃下转移至介质SDAY板涂覆玻璃纸并放置在恒温培养箱中4〜6天,将其侵入没有多少数量。无菌条件下除去孢子形菌丝体,置于无菌5ml微量离心管中,桂花树价格冻干并储存在-20℃直至使用。用改良的CTAB方法[24]提取白僵菌的基因组DNA。
40个引物的37个souches.Les号码和引物序列进行PCR扩增选择具有清晰的多态性,重复性高十一ISSR引物示于表1扩增反应与ISSRPCR反应系统25微升:超纯水(ddH 2 O中)19.5微升,10×缓冲液缓冲液(含Mg 2+的)2.5微升,的dNTP(浓度为2.5mmol / L)1.25微升,引物(浓度为10毫摩尔/ L 0.1μL,Taq DNA聚合酶(5U /μL)0.2μL,50ng /μL的0.5μL模板DNA。PCR扩增过程ISSR:预变性94℃5分钟,变性在45℃下45秒,退火温度1分钟,延伸72℃1分钟,35个循环,延伸在72℃ 10分钟每种引物测试三次,每个反应用无矩阵空白对照物制备。过2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。动读取ISSR电泳凝胶图像,并将每个扩增的片段计数为多态性位点。ISSR是显性标记和各样品的扩增条带被记录有或没有带,条带1和条带无0 DNA凝胶的电泳图被转换成数值矩阵。物NTSYSpc 2.1软件被用于使用软件PopGen 32分析所有人群和所有种群的遗传参数来分析每个应变之间的关系的树,并计算观察到的等位基因的数目(NA)。位基因数(NE),基因多样性指数NEI(1973年)(他),索引信息香农多样性(I),多态位点(PPL)的百分比,基因内基因多样性(HS)基因总人口多样性(Ht),群体间遗传分化系数(Gst),Nei遗传距离(1978)(D)和遗传同一性(I)。预试验中,选择40个引物,并调整为与确定的结果stables.Les 11米的引物具有良好的多态型的光带不同的引物的退火温度被用来分析37株球孢白僵菌。态性检测。表2所示,11种引物能够扩增所测试的37种菌株的光和亮条带,并且条带以合理的方式分布。同引物共扩增出83条带,其中多态性带69条,多态性百分率为83.13%。
体之间的基因流动为1.530 8.表3-5显示三个群体之间的基因流动和由此产生的基因分化差异很大,包括在阳阳县和Gu阳县的基因流动。城是最大的(4,563 7),基因分化系数最低(0,051 9),两个采样点之间的地理距离为44 km。蒙城和萧县县基因流最低(1.237 1),基因分化系数最高(0.168 1)和两个采样点之间的地理距离为133公里。Gu阳县和萧县的基因流量为1,889 7,基因分化系数为0.116。个采样点之间的地理距离为84公里。表明遗传分化系数与地理位置无关。过使用软件来涡阳,蒙城和萧县的县的三个群体的两个群体之间分析POPGENE 32 NEI遗传同一性(I)和标准遗传距离(d)中,我们发现,不同区域之间的遗传距离( D)在0.048和0.1244之间,平均值为0.085,遗传同一性(I)在0.883和0.952之间,平均值为0.918(表3-6)。中,涡阳和蒙城之间的遗传一致性最高(0.952 4)中,遗传距离是接近的(0.048 8),蒙城和萧县间的遗传一致性是最低(0.883 0)和遗传距离是最远的(0.124)。4)根据扩增的ISSRPCR条带的存在或不存在,计数稳定和清晰的条带,计数为0.1。
该研究中,通过初步实验调节一些引物的退火温度。是,该测试没有研究其他因素的影响,如仪器类型,反应体积等。于扩增产品。者检查了实验前置放大器40个引物和扩增引物stables.Les 11个引物的37好多态性扩增多态性株白僵菌和分析了放大地图ISSR 。物表现出较高的遗传多态性,多态性条带达到83.13%,扩增结果具有高度可重复性。此,ISSR分子标记是研究白僵菌等白僵菌的遗传多样性和种群结构的有效方法。POPGENE 32软件进行了分析,分析了安徽省不同地区37株的群体遗传多样性。果表明,从安徽省3个不同地区分离的球孢白僵菌的遗传多样性优越,呈多态性。因座百分比(PPL)为83.13%,Nei遗传多样性指数为0.316,Shannon信息指数为0.465 7.遗传变异的结果表明存在分化。同的遗传群体白僵菌之间:三个群体的总遗传多样性是0.140 4.使用软件群体内0.301 1遗传多样性0.258 8和分化NEI基因的系数NTSYSPC,基于个体之间的遗传距离构建了37株球孢白僵菌菌株的遗传系统发育图谱。果表明,37个测试菌株不按地理种群聚类,分类组按地理划分。源之间没有直接的相关性,进一步表明种群间的遗传变异较小,可能是因为从桂花根际土壤中分离出的37株白僵菌(Beauveria bassiana)。在于根际土壤中。孢白僵菌可以受到土壤中复杂环境因素的影响,并且可以进行突变以适应相应的环境变化。项研究的结果表明,涡人口涉及的所有群体,表明人口有最大的遗传异质性,第二是蒙城,谁没有第Ⅲ部分的人口,而人口xiaoxienne具有最低的遗传异质性,并且汇集了所有七个菌株。第一个主要类别。
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