[桂花树价格]分子标记技术及其在桂花遗传选择中的应用
时间:2019/10/24 6:33:55 浏览量:
概述了分子标记的基本类型,并在分子多样性分析,种子纯度鉴定,遗传图谱构建,基因作图方面进行了分子标记技术研究。述了桂花的分子标记辅助选择方法。析了应用前景,以促进分子标记技术在桂花遗传选择中的更好应用。传标记包括形态标记,细胞标记,生化标记和分子标记,它们是植物遗传改良的有力工具[1]。中,前三个遗传标记是对基因的间接反应,是差异基因表达的结果。子标记物是为DNA开发的遗传标记物,可直接对核苷酸差异做出反应,并且具有优于传统标记物的优越性:区分所有基因型的共性以及极高和定量的多态性。几乎是无限的,分析的结果不受材料的位置和时间的限制,它们不影响植物的正常活动或目标性状的表达。前,DNA分子标记技术已广泛应用于植物遗传选择研究,已成为分子选择的重要方向。蓝型油菜(Brassica campestris syn.rapa L.ssp.pekinensis)是芸苔属的桂花属的一个亚种,原产于中国,在世界范围内栽培了5,000多年。常生活中最重要的蔬菜之一。着分子标记技术的飞速发展,无臭桂花的遗传选择得到了前所未有的修改:已广泛用于构建遗传图谱,遗传多样性分析,遗传图谱,桂花种子纯度的鉴定和分子标记。助选择和选择等,极大地促进了桂花新品种的选择。者综述了分子标记的常见类型及其在桂花选择中的应用,为桂花的遗传选择提供参考。子标记直接反映核苷酸的个体差异。子标记通常分为三类:一类基于Southern杂交,桂花树价格例如RFLP;另一类基于基于PCR的标记技术,例如RAPD,ISSR和SSR。PCR与AFLP和CAPS等标记技术相结合。前,主要的桂花开花产品是RFLP,RAPD,ISSR,SSR和AFLP。制性片段长度多态性(RFLP)RFLP标记是由Botstein等人[2]于1980年发现的。是第一代分子标记,已广泛用于植物遗传学研究。择。本原理:限制性核酸内切酶用于鉴定和切割个体的基因组。过PAGE电泳分离后,进行与特定探针的Southern杂交,然后通过放射自显影或其他显色技术进行检测以获得RFLP基序。切割位点之间存在差异时,这将导致RFLP上的多态性。RFLP标记是第一代分子标记,具有强大的共显性和稳定性。已经成为基因选择研究中领先的分子标记工具。着PCR技术的诞生和发展,RFLP已逐渐被其他易于检测且具有高多态性信息的标记所取代。机扩增多态性(RAPD)DNA Welsh等。[3]在1990年基于PCR技术开发了RAPD分子标记技术。理:通过在生物基因组中使用大量反向重复序列,可以使用单个随机引物扩增重复序列之间的片段, PCR产物可以通过凝胶电泳和染色检测。果引物的结合位点发生突变,或者在扩增的片段中发生核苷酸的插入/缺失,则可能会发生多态性。RFLP标记相比,RAPD标记具有以下优点:非常通用,可以共享RAPD标记,少量的DNA样品可以满足RAPD的需要,检测方便且成本低高。时,RAPD也有一些缺点:RAPD标记的可重复性和稳定性差,并且对反应条件极为敏感; RAPD标记是主要标记,不能用于基因型分析。部简单重复序列(ISSR)ISSR技术是蒙特利尔大学Zietkiewicz等人开发的一种新的分子标记技术。[4],1994年。本原理:简单的SSR重复序列广泛存在于基因组中,并有2至4个随机碱基随机锚定在SSR重复序列的3'或5'末端以形成引物。增,通常长16至18 bp。PCR反应扩增位于两个特定SSR位点之间的DNA片段。SSR序列的重复次数不同或锚定位点突变时,扩增的片段是多态的。ISSR标记技术结合了SSR和RAPD技术的优点:相对于RAPD标记具有更高的稳定性,比SSR标记具有更低的引物设计成本,缺点是ISSR标记是主要标记而不具有优势不能进行基因分型。
列重复(SSR)SSR标记(也称为微卫星标记)是一类DNA序列,由1至6个核苷酸组成,串联并串联重复,广泛分布于基因组中。本原理:当图案的重复次数不同或未完全重复时,这将导致扩增片段的大小不同,从而导致位点多态性。据微卫星两侧的保守序列,设计了特异性引物,并通过PCR扩增和PAGE电泳获得了SSR位点[5]。RAPD标记相比,SSR标记具有以下优点:SSR标记长度可变,桂花树价格并且具有多态性; SSR标记是共性标记,可用于基因分型; SSR标记可通过特异性引物扩增稳定性和可重复性更好。SSR品牌的缺点是开发成本高,耗时且费力。
增片段长度多态性(AFLP)Zabeau等。[6]在1993年基于RFLP和RAPD两种标记技术发明了AFLP标记技术。本原理:限制性核酸内切酶用于消化基因组DNA,该片段与特定的接头连接在T4 DNA连接酶的作用下形成特定的DNA片段,然后对其进行预扩增和选择性扩增。切割位点或选择性碱基结合位点突变时,形成多态性。AFLP结合了RFLP和RAPD的优势:少量DNA样品可以满足分析需求,稳定性,可靠性,其中大多数是主要标记,多态性也是高。点是测试过程复杂且昂贵,并且DNA的质量很高。传多样性分析遗传多样性是作物遗传改良和选择新品种的基础。子标记技术可以克服传统的遗传多态性与现场表型分析的弱点,具有高多态性,稳定性和客观性的优点,是一种强大的工具物种遗传多样性的研究。Lamboy等[7],Sun Deling等[8],Guo Jingxin等[9]使用不同的标记技术来分析具有愉悦气味的桂花蔬菜的遗传关系,结果表明酞菁和蔬菜桂花关系密切。气球桂花和大桂花之间存在一定的遗传距离,它们被组合在一起。宝勇等。[10]利用RAPD分子类型技术将11种大桂花遗传物质分为三种类型:直型,右过渡型,短堆型和短堆型。波等[11]利用AFLP技术研究了96种桂花遗传物质的遗传关系,结果表明可能有两个不同的起源。顺华等[12]通过RAPD技术分析了64种桂花资源的遗传多样性,显示桂花具有丰富的遗传基础,相似系数为0.951,最小值为0.681。用分子标记技术进行的遗传多样性分析不同于传统的形态学分类结果,这可能是由于材料内在基因的表达有限或基因组之间缺乏相关性造成的。达效果和外部形态。用分子标记对遗传多样性进行分析可以同时反映出形态学和表观形态之间核苷酸的潜在差异,结果更加准确。子纯度的鉴定纯度和真实性是衡量种子质量的主要标准。统的形态学识别方法可能会影响环境。需要很多时间并且很费力。不能满足当年使用的物种的要求。传指纹技术是近年来基于分子标记技术的种子纯度控制的一种新方法,具有以下优点:简单,方便,成本低,多态位点丰富,对种子无影响。境。已成为鉴定种子纯度的有力工具。顺华等。[13]使用AFLP引物的组合来研究90种大桂花材料,并获得了能够完全区分90种桂花材料的E-ACA / M-CTG引物组合。
晓义等。[14]用指纹图谱鉴定了80个小桂花品种,并使用80对引物组合来完全区分80个小桂花品种。树贵等[15],关志坤等[16]利用RAPD技术和SSR技术研究了种子的纯度,获得了可用于鉴定“中薯5号”纯度的分子标记。鉴定了“玉盘3号”的纯度。因图谱的构建基因图谱是进行遗传研究的有力工具。已被广泛用于遗传作图,卡克隆和比较基因组学研究,以提高繁殖效率。统的遗传图谱是用形态学和生化标志物构建的,充满了诸如标志物数量有限和光谱密度低等问题:它不能很好地反映基因组的整体情况,其应用受到限制。分子标记构建的高密度遗传图谱克服了传统遗传图谱的不足,已被广泛用于作物遗传育种研究。Song和他的合作者[17]构建了桂花的第一个大型遗传图谱RFLP,其中桂花“ Michili”和“ Spring Broccoli”变种完全开花,全长为1 850 cM,包括10个结合基团和280个分子标记位点RFLP。Ajisaka等。[18]用不同品种的桂花构建了第一张桂花的RAPD分子标记图谱,包括115种RAPD标记和2种同工酶标记,图谱长度为860 cM。鲁刚等。[19]用大桂花和酞菁为亲本构建了F2定位种群,并利用RAPD分子标记技术构建了桂花的第一个遗传图谱,具有84个多态性位点,全长1 632.4厘米平均距离为16.5 cM。刚等[20]利用芜菁和桂花F2构建了AFLP图谱,包括131个AFLP标记和12个连锁组,总长度为1810.9 cM。Yukang等[21]绘制了一个包含87个RAPD标记和265个AFLP标记的图谱,其中包含102株桂花的F6(NIL)重组株,全长2665.7 cM,包括17个结合基团。均距离为7.6 cM。梅和他的合作者[22]用DaMV黄新高干TuMV和Baixingao抗TuMV花株构建了DH系,并构建了一个AFLP图谱,全长883.7 cM和255个标记。Soengas等[23]用223个AFLP和23个SSR标记构建了一个遗传图谱,共有664个AFM和10个连接基团。等。[24]使用桂花线“ Chiifu-401-42”和“ Kenshin-402-43”为父母构建了一个多标记图,总长为1182 cM,距离为平均地图。2.83 cM,包含10个接头,278个AFLP标记,235个SSR标记,25个RAPD标记和18个EST-STS-CAPS标记。俊华等。
高繁殖效率。
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列重复(SSR)SSR标记(也称为微卫星标记)是一类DNA序列,由1至6个核苷酸组成,串联并串联重复,广泛分布于基因组中。本原理:当图案的重复次数不同或未完全重复时,这将导致扩增片段的大小不同,从而导致位点多态性。据微卫星两侧的保守序列,设计了特异性引物,并通过PCR扩增和PAGE电泳获得了SSR位点[5]。RAPD标记相比,SSR标记具有以下优点:SSR标记长度可变,桂花树价格并且具有多态性; SSR标记是共性标记,可用于基因分型; SSR标记可通过特异性引物扩增稳定性和可重复性更好。SSR品牌的缺点是开发成本高,耗时且费力。
增片段长度多态性(AFLP)Zabeau等。[6]在1993年基于RFLP和RAPD两种标记技术发明了AFLP标记技术。本原理:限制性核酸内切酶用于消化基因组DNA,该片段与特定的接头连接在T4 DNA连接酶的作用下形成特定的DNA片段,然后对其进行预扩增和选择性扩增。切割位点或选择性碱基结合位点突变时,形成多态性。AFLP结合了RFLP和RAPD的优势:少量DNA样品可以满足分析需求,稳定性,可靠性,其中大多数是主要标记,多态性也是高。点是测试过程复杂且昂贵,并且DNA的质量很高。传多样性分析遗传多样性是作物遗传改良和选择新品种的基础。子标记技术可以克服传统的遗传多态性与现场表型分析的弱点,具有高多态性,稳定性和客观性的优点,是一种强大的工具物种遗传多样性的研究。Lamboy等[7],Sun Deling等[8],Guo Jingxin等[9]使用不同的标记技术来分析具有愉悦气味的桂花蔬菜的遗传关系,结果表明酞菁和蔬菜桂花关系密切。气球桂花和大桂花之间存在一定的遗传距离,它们被组合在一起。宝勇等。[10]利用RAPD分子类型技术将11种大桂花遗传物质分为三种类型:直型,右过渡型,短堆型和短堆型。波等[11]利用AFLP技术研究了96种桂花遗传物质的遗传关系,结果表明可能有两个不同的起源。顺华等[12]通过RAPD技术分析了64种桂花资源的遗传多样性,显示桂花具有丰富的遗传基础,相似系数为0.951,最小值为0.681。用分子标记技术进行的遗传多样性分析不同于传统的形态学分类结果,这可能是由于材料内在基因的表达有限或基因组之间缺乏相关性造成的。达效果和外部形态。用分子标记对遗传多样性进行分析可以同时反映出形态学和表观形态之间核苷酸的潜在差异,结果更加准确。子纯度的鉴定纯度和真实性是衡量种子质量的主要标准。统的形态学识别方法可能会影响环境。需要很多时间并且很费力。不能满足当年使用的物种的要求。传指纹技术是近年来基于分子标记技术的种子纯度控制的一种新方法,具有以下优点:简单,方便,成本低,多态位点丰富,对种子无影响。境。已成为鉴定种子纯度的有力工具。顺华等。[13]使用AFLP引物的组合来研究90种大桂花材料,并获得了能够完全区分90种桂花材料的E-ACA / M-CTG引物组合。
晓义等。[14]用指纹图谱鉴定了80个小桂花品种,并使用80对引物组合来完全区分80个小桂花品种。树贵等[15],关志坤等[16]利用RAPD技术和SSR技术研究了种子的纯度,获得了可用于鉴定“中薯5号”纯度的分子标记。鉴定了“玉盘3号”的纯度。因图谱的构建基因图谱是进行遗传研究的有力工具。已被广泛用于遗传作图,卡克隆和比较基因组学研究,以提高繁殖效率。统的遗传图谱是用形态学和生化标志物构建的,充满了诸如标志物数量有限和光谱密度低等问题:它不能很好地反映基因组的整体情况,其应用受到限制。分子标记构建的高密度遗传图谱克服了传统遗传图谱的不足,已被广泛用于作物遗传育种研究。Song和他的合作者[17]构建了桂花的第一个大型遗传图谱RFLP,其中桂花“ Michili”和“ Spring Broccoli”变种完全开花,全长为1 850 cM,包括10个结合基团和280个分子标记位点RFLP。Ajisaka等。[18]用不同品种的桂花构建了第一张桂花的RAPD分子标记图谱,包括115种RAPD标记和2种同工酶标记,图谱长度为860 cM。鲁刚等。[19]用大桂花和酞菁为亲本构建了F2定位种群,并利用RAPD分子标记技术构建了桂花的第一个遗传图谱,具有84个多态性位点,全长1 632.4厘米平均距离为16.5 cM。刚等[20]利用芜菁和桂花F2构建了AFLP图谱,包括131个AFLP标记和12个连锁组,总长度为1810.9 cM。Yukang等[21]绘制了一个包含87个RAPD标记和265个AFLP标记的图谱,其中包含102株桂花的F6(NIL)重组株,全长2665.7 cM,包括17个结合基团。均距离为7.6 cM。梅和他的合作者[22]用DaMV黄新高干TuMV和Baixingao抗TuMV花株构建了DH系,并构建了一个AFLP图谱,全长883.7 cM和255个标记。Soengas等[23]用223个AFLP和23个SSR标记构建了一个遗传图谱,共有664个AFM和10个连接基团。等。[24]使用桂花线“ Chiifu-401-42”和“ Kenshin-402-43”为父母构建了一个多标记图,总长为1182 cM,距离为平均地图。2.83 cM,包含10个接头,278个AFLP标记,235个SSR标记,25个RAPD标记和18个EST-STS-CAPS标记。俊华等。
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