[桂花树价格]魔芋中桂花花叶病毒的分子检测方法
时间:2019/12/2 6:33:34 浏览量:
为了建立有效检测魔芋中桂花花叶病毒的方法,采用实时ELISA,RT-PCR和PCR检测方法检测花叶病毒。芋中的桂花(CMV)。果表明,桂花花叶病毒在魔芋叶片中的不稳定程度较小,并且酶联酶检测和RT-PCR都不能有效检测花叶病毒。花。
有实时PCR可以检测到它。结果为魔芋中桂花花叶病毒的快速,准确分子鉴定提供了技术支持。芋(魔芋魔芋)是魔芋属多年生草本植物,含有大量的葡甘露聚糖,已有2000多年的历史[1]。年来,随着葡甘露聚糖产品的发展,食品,化学和保健品市场对魔芋产品的需求逐年增加。而,由于多年生魔芋的无性繁殖,不能保证病毒的积累,物种的降解,高产和高质量,这一问题严重限制了魔芋人工林的发展。个部门[2]。瓜花叶病毒(CMV)是Bromoviridae家族的Cucumovirus属的典型成员,该病毒在全球范围内分布。
具有广泛的寄主范围,可以感染52个科的174属775株植物[3]。感染了桂花花叶病毒的叶子上,特别是嫩叶上,会出现黄绿色花或叶绿体梭形斑点形式的条纹,并且叶子的边缘略微卷曲[4]。究表明,CMV包膜蛋白(CP)与病毒颗粒组装和蚜虫传播有关[5,6]。目前为止,还没有针对CMV开发出一套安全,有效和稳定的病毒预防和控制技术。此有必要对其进行研究。前,用于检测CMV的方法主要是ELISA,桂花树价格电子显微镜和PCR [7-9]。时荧光定量PCR是指将荧光团添加到PCR反应系统中的方法,它利用荧光信号积累来实时监控整个PCR过程并最终进行定量使用标准曲线的未知模型。常规PCR相比,它具有以下优势:高特异性,高灵敏度,良好的重现性,精确的定量,高度自动化和完全受控的响应,成为分子生物学研究的重要工具。时定量PCR具有广泛的应用,包括mRNA表达的研究,DNA拷贝数的检测和单核苷酸多态性的确定[10]。
前,关于魔芋疾病,特别是魔芋桂花叶病毒的研究很少,这种病毒仍然是处女。此,在结合以往植物病毒检测特性的研究基础上,本研究建立了一种实时PCR检测桂花花叶病毒的方法,并将其与魔芋病毒的ELISA和RT-PCR。速诊断提供了技术基础。花花叶病毒是从带有桂花花叶病毒的辣椒叶中提取的。种物是无魔芋魔芋cv病毒的植物。江,获自组织培养。剂:植物总RNA提取试剂盒(天健生化科技有限公司),5×M-MuLV逆转录酶缓冲液,M-MuLV逆转录酶(Promeg Biotechnology Co.,Ltd。dNTP ,10×Taq反应缓冲液,Taq DNA聚合酶,DL 2000标记(北京鼎国昌盛生物技术有限公司),6×上样缓冲液(宝生物工程有限公司),CMV ELISA试剂盒(北京Boosid生物技术) Co.,Ltd。THUNDERBIRD SYBR qPCR Mix 2.0(Toyobo Biotechnology Co.,Ltd.)。物由英军生物有限公司合成。上海舜宇生物技术有限公司确定。器:SIGMA 2-16K高速离心机,Elx800酶标仪,ABI第一步荧光定量PCR仪。毒的接种将含有病毒(约0.5 g)的新鲜辣椒叶切成薄片,并在接种缓冲液(5 ml PBST,0.1 g PVP-40、0.005 g BSA, 0.022克铜试剂)。一小块纱布过滤到1.5毫升的EP管中,并插入冰水中以备后用。一根干净的钢丝球,取下生病的汁液并将其擦在健康的魔芋叶子上,接种后,用去离子水冲洗叶子表面以消除棉塞对皮肤的影响。片代谢。天后,观察到斑点魔芋植物。1)和叶片卷曲(图2)是桂花叶病毒感染的两个典型症状,表明桂花叶病毒已经成功感染了健康的魔芋植物。过人工接种。DAS-ELISA检测用桂花花叶病毒称取0.3 g魔芋叶,加入3 mL PBS(pH 7.4),用手或匀浆研磨样品,离心20分钟并收集上清液。个必须在包装后进行测试,另一个必须冷冻以备后用。考ELISA试剂盒方法,在反应停止后15分钟内,使用酶标仪读取并测量405 nm的OD值。据判断标准:阳性对照平均值≥1.00,阴性对照平均值≤0.10,临界值=阴性对照孔+ 0.15,样品的OD值<临界值为负且值为样品的OD≥临界值为正。RT-PCR检测使用总植物RNA提取试剂盒从魔芋叶中提取总RNA,并作为阳性对照,从桂花花叶病毒辣椒叶中提取总RNA。体方法根据说明进行。 GTTTCGCG-3',5'-CGGCGTACTTCTCATGTCAC-3',扩增的靶序列片段的长度为230bp。系统:总反应系统25μL,加入总感染的魔芋RNA 1μg,Oligo dT 15 2μL(0.5μg/μL),于72变性5分钟,立即移出并置于冰上5分钟然后加入5×M-MuLV 5μL逆转录酶缓冲液,2μLdNTP(10 mmol / L),1μL(50 U /μL)M-MuLV逆转录酶,然后加入经DEPC处理的ddH2O5。升。反应混合物在PCR仪器中在42℃下保存90分钟,并在70℃下保存10分钟,并在-20℃的温度下保存直至使用。 PCR系统(25μL):1.5μLcDNA,1μL(10μmol/ L)每种引物,0.5μLdNTP(10 mmol / L),2.5μL10×缓冲液, 2μL(25 mmol / L)的MgCl 2,Taq酶。1 U /μL,ddH2O 15.5μL。PCR反应步骤:采用标准PCR,在94℃预变性5min,在94℃变性30s,在56℃退火30s,在72℃延伸5min,36个循环,最后在72℃ 5分钟取4μLPCR产物,约1μL溴酚蓝,使用DL 2,000作为标记物和琼脂糖凝胶电泳(1.0%凝胶浓度,TBE缓冲液系统)。EB染色后,在标准UV中使用凝胶成像系统。灯光下成像。时PCR检测用于实时PCR的引物与用于RT-PCR的引物相同。应体系为20μL:2μL反向模板cDNA,2.0×SYBR Master Mix 10μL(已添加Rox),上下游0.5μL(20μmol/ L)引物和去离子水组成20μL。PCR反应的时间表是在95°C下进行40循环15秒,在60°C下进行1分钟。带有桂花花叶病毒的辣椒叶用作阳性对照,每个样品安装三份重复样品,并在ABI Step One实时PCR仪上进行反应。PCR产品已发送至上海舜宇生物技术有限公司。于DNA测序,并提供了DF产品和引物用于单向测序。Clustal X 1.83软件分析DNA序列,并在NCBI上进行BLAST序列的比对。CMV ELISA试剂盒检测了带有桂花叶病毒的魔芋叶,检测结果为阴性,表明桂花叶病毒对叶的ELISA敏感性魔芋很虚弱。花花叶病毒接种的魔芋叶在RT-PCR下未扩增目标条带,而阳性对照扩增了目标条带约230 bp(图3)。芋叶有典型的桂花感染。叶病毒的症状,但其病毒载量远低于胡椒的载量,很难通过普通PCR检测到。花叶病毒在魔芋叶片中的实时PCR结果如图4所示。图4中可以看出,在阳性对照和在阴性对照中均检测到荧光信号。CT = 30的样品的荧光信号在大约36个循环中达到了平稳期,从融解曲线可以看出,该条带的特异性很强,可以通过以下方法确定基本方式。是靶序列扩增的结果。增的条带序列和相应的桂花花叶病毒序列的覆盖率可以达到100%,相似性可以达到99%,表明所得的DNA片段是CMV基因的片段。
果表明,实时荧光定量PCR可以准确检测魔芋植物中的CMV。先前的实验中,魔芋中的桂花花叶病毒研究很少,并且检测困难,其中选择了ELISA,RT-PCR和实时PCR三种方法检测并比较魔芋叶片中的桂花花叶病毒。果表明,ELISA法和RT-PCR法不能有效地检测魔芋中的桂花花叶病毒,因为魔芋叶上的桂花花叶病毒具有较低的毒性和理化特性。子中的多糖与RNA相似。时,多糖RNA也被去除,导致RNA产量下降,而多糖沉淀,使两者难以分离,导致RNA降解和损失。有多糖的RNA沉淀物难溶于水或溶解的溶液具有很高的粘性,这会抑制许多酶的活性[12],导致所得RNA的浓度降低,因此很难用普通的检测方法进行检测。时PCR技术是近年来发展最快的技术之一。 结合了荧光技术和常规PCR扩增系统,克服了常规PCR技术的弱点并简化了检测过程。的灵敏度很高,可以达到普通PCR反应的100倍[11]。其是,使用SYBR Green I荧光染料进行实时PCR便宜,可以有效地检测魔芋叶片中的桂花花叶病毒,并可用于检测花叶病毒病。芋种植区中的魔芋桂花。外,该方法可以用于病毒载量的绝对定量,桂花树价格并且该技术还可以用于研究植物中CMV的运动,抗病遗传物质资源的筛选,宿主-介体的相互作用。毒等
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具有广泛的寄主范围,可以感染52个科的174属775株植物[3]。感染了桂花花叶病毒的叶子上,特别是嫩叶上,会出现黄绿色花或叶绿体梭形斑点形式的条纹,并且叶子的边缘略微卷曲[4]。究表明,CMV包膜蛋白(CP)与病毒颗粒组装和蚜虫传播有关[5,6]。目前为止,还没有针对CMV开发出一套安全,有效和稳定的病毒预防和控制技术。此有必要对其进行研究。前,用于检测CMV的方法主要是ELISA,桂花树价格电子显微镜和PCR [7-9]。时荧光定量PCR是指将荧光团添加到PCR反应系统中的方法,它利用荧光信号积累来实时监控整个PCR过程并最终进行定量使用标准曲线的未知模型。常规PCR相比,它具有以下优势:高特异性,高灵敏度,良好的重现性,精确的定量,高度自动化和完全受控的响应,成为分子生物学研究的重要工具。时定量PCR具有广泛的应用,包括mRNA表达的研究,DNA拷贝数的检测和单核苷酸多态性的确定[10]。
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