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[桂花树价格]山东桂花绿斑花叶病毒感染丝瓜病毒的分子鉴定

时间:2019/12/5 6:31:49 浏览量:
  
  在山东省泰安市收集了怀疑被黄瓜绿腐烂花叶病毒(CGMMV)感染的丝瓜样品。毒外壳蛋白(CP)CG-CPF / CPR扩增子和测序仪的特异性引物。

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  过NCBI BLAST比较获得的序列(GenBank登录号:KJ187042),与记录的CGMMV序列的相似性大于92.6%,被确定为大理石花叶病毒。花绿。统发育分析表明,大多数CGMMV的国内分离株,如CGMMV山东蚕(CGMMV-SDLoofah)和辽宁(CGMMV-LN)分离株,都被归为进化组,桂花树价格这证实了该分离株CGMMV山东丝瓜病病毒是桂花。色花叶病毒。是首次报道丝瓜病毒感染了带有桂花和甜味的绿色害虫花叶病毒。瓜猕猴花叶病毒(CGMMV)是烟草花叶病毒属的成员,最早发现于桂花上,寄主是西瓜,甜瓜,南瓜和其他植物。

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  要症状是大理石叶子和全身性花叶病。
  西瓜中,该病毒经常引起腐烂和变质,桂花树价格并失去其商业价值,是影响葫芦科的重要病毒性疾病,常常导致产量和质量严重下降,构成了中国进入该国的植物检疫寄生虫。

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  CGMMV在日本和韩国等东亚国家以及西亚的阿拉伯地区和中亚的巴基斯坦[1]很普遍。中国,2004年首次从日本进口的南瓜种子中检测到并截获了CGMMV。

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  005年,秦碧霞等在广西的观赏南瓜中发现了该病毒,然后进行了报道。辽宁,北京,山东,甘肃,广东等地。病毒在野外被破坏[3〜6]。
  中国,大多数被该病毒感染的葫芦科蔬菜是西瓜,桂花,西葫芦和南瓜,2013年首次在丝瓜中检测到CGMMV,其包膜蛋白基因为以分子方式测序和鉴定。感样品的采集2013年,在山东泰安的一个野外采集了要测试的丝瓜样品,并将其保存在-80°C的冰箱中,以进行RNA提取等后续实验。株,载体和试剂克隆载体pMD18-T购自TaKaRa公司;大肠杆菌DH5α菌株已保存在该实验室中。RNA提取试剂购自天根公司; RNase抑制剂RTase M-MLV(RNase H-)T4 DNA连接酶购自TaKaRa公司,杭州爱信生物技术有限公司的AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒,Easy DNA Polymerase Taq,dNTP和Trans 2K Plus DNA分子量标准品购自北京。公司,其他生化试剂和普通化学试剂均为进口或国产等级。灵敏丝瓜样品中提取总RNA并通过RT-PCR扩增称取0.1 g宿主植物叶片,用液态氮粉研磨,然后根据以下步骤从叶片中提取总RNA: TRIzol方法用于随后的cDNA合成。瓜植物的总RNA用作阴性对照。物设计和RT-PCR扩增参考GenBank序列HM008919设计上游引物(CG-CPF,位于5763-5765):5'-ATGGCTTACAATCCGATCACACC-3';下游引物(CG-CPR,位于6224-6248):5'-CTAAGCTTTCGAGGTGGTAGCCTC-3',扩增产物的预期大小为486 bp。转录系统:6.0μL模板RNA,2.0μL下游引物,5.5μL不含RNase的H2O,在70°C变性10分钟,并在冰上放置2分钟分钟,然后添加以下试剂:缓冲液5 x M-MLV 4μL,dNTP混合物(每个10 mmol / L)1.0μL,RTase M-MLV(RNase H-)(200 U /μL)1.0μL RNase抑制剂(40 U /μL)0.5μL,总体积为20μL。42°C下孵育60分钟,然后在70°C下孵育15分钟。2μL以上反应产物作为PCR反应的模板。PCR反应条件:94℃3分钟,1周期,94℃30秒,50℃30秒,72℃50秒,25周期,72℃5分钟。PCR扩增产物克隆到pMD18-T载体中,转化感受态DH5α细菌细胞,选择阳性克隆,上海博尚生物技术有限公司被指示在两个方向上完成测序。列比对分析BLAST用于比较病毒样品包膜蛋白的核苷酸测序结果,NCBI记录的CGMMV包膜蛋白的代表性序列(表1)为由MegAlign在DNAStar软件中选择并已知。过共有序列分析序列,并使用Mega 5.0的邻接法构建系统发育树。亚洲,韩国自1995年以来就患有桂花大理石纹花叶病毒病[11],而日本早在1971年就在关东地区的大部分地区感染了这种疾病。]。互传播和传播的主要原因[13〜15]。们普遍认为,这种疾病来自日本和韩国等流行地区的引进种子[5,6,9]。CGMMV的引进和运输应成为CGMMV在山东及中国其他地区(尤其是蔬菜种植区)传播的主要驱动力,以加强种子检疫和加工。
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